Le lait et les produits laitiers ont une place importante dans le régime alimentaire de la population algérienne. En effet, la qualité microbiologique de ces produits est un sujet relativement nouveau, qui intéresse de plus en plus les acteurs de la filière lait en Algérie. Jusqu’à présent, le lait produit localement est souvent chargé en microorganismes, préjudiciable pour la consommation humaine et à la transformation en industrie laitière. Le premier objectif de cette étude est d’évaluer la qualité hygiénique et sanitaire du lait cru produit à travers la chaine de production dans la wilaya de Tizi Ouzou (Algérie). Un second objectif est de caractériser les souches de Staphylococcus aureus circulant dans le lait et les produits laitiers sur le plan phénotypique et génotypique. Pour cela, 270 échantillons du lait et de produits laitiers traditionnels sont prélevés et soumis aux analyses microbiologiques. Les souches de S. aureus isolées sont soumises à la recherche des gènes d’entérotoxines, puis à l’étude de leur résistance aux antibiotiques. Les résultats de cette étude montrent que la contamination microbienne du lait cru augmente tout le long de la chaine de production du lait. En effet, la charge moyenne en flore aérobie mésophile totale à la ferme est de 6.73±0.25 log10 ufc/ml. Cette charge augmente pour atteindre des charges de 6.81±0.19 log10 ufc/ml et 7.2±1.05 log10 ufc/ml aux centres de collecte et aux points de vente respectivement. En plus, des cas de contaminations par des coliformes fécaux et des résidus d’antibiotiques sont observés. 69 souches de S. aureus sont isolées, avec une fréquence de contamination de 22.96%. Les gènes d’entérotoxines sont détectés chez 17 isolats (24.63%). Les plus identifiés sont seb et sep. De fortes résistances sont observées vis-à-vis de la pénicilline G (91.30%) et de la tétracycline (47.83%). Onze souches parmi 69 (15.94%) sont résistantes à la méticilline (SARM). Toutes les souches SARM isolées portent le gène mecA et appartiennent au même spa-type (t024) et au même PFGE cluster. Cependant, aucune de ces souches ne portent le gène codant pour la toxine pvl. Les résultats de cette étude révèlent que la consommation de lait cru et de produits laitiers traditionnels peut constituer un risque potentiel pour la santé publique. Pour cela, l’application de bonnes pratiques d’hygiène et de production sont nécessaires pour améliorer la qualité et la sécurité sanitaire des ali